五、Calculate 菜单功能说明

四、Calculate 菜单功能说明

1

Properties

计算任意可用的物理化学、ADME和毒性相关属性。打开属性计算列表窗口。

2

Categories

使用内置分析功能，根据最相关的物理化学、ADME和毒性属性将化合物区分为定性类别（Good、Average、Bad和Unknown）。打开类别计算列表窗口。

3

Rank

执行化合物排序，即根据所选物理化学、ADME或毒性属性的有利/不利特征进行优先级排序。打开排序窗口。

4

Expression

打开表达式编辑器窗口。表达式编辑器用于通过对现有列进行逻辑、数学或文本操作来计算新列。

注意：

ACD/Percepta利用多计算线程的优势，因此即使在电子表格计算进行期间，仍保留部分基本功能（例如浏览电子表格或在模块视图中执行详细单结构分析）。无论对电子表格应用何种筛选条件，开始计算程序时都会检索所有化合物并预测其对应值（以便后续更改筛选条件时无需重新计算）。程序完成所有计算后，筛选条件会重新应用

1. Properties(该功能需单独购买)

计算各类可用的物理化学（PhysChem）、ADME（吸收/分布/代谢/排泄）及药物安全（Drug Safety）相关属性。

操作说明：

• 在文本框中输入内容可执行快速搜索
• 显示可计算的属性列表注意：
  实际可用属性列表取决于软件许可配置（即 Module View 下启用的单结构计算模块组合）
• 点击单个算法进行选择（按住 Ctrl 键可多选）
• 使用箭头按钮在窗格间移动所选字段：
• 移动单个/多个选定字段
  
• 移动所有字段
  
• 显示已选择待计算的属性列表
• 点击"+"和"-"图标展开/折叠计算所需参数列表
• 点击 + 图标添加必要参数注意：
  最多可添加5个指定参数
• 输入所需参数值
• 计算模板管理
• 下拉列表显示所有可用模板（选择即可应用）
• Save：更新当前激活模板/若无激活模板则新建
• Save as...：将当前配置另存为新模板
• Remove from list：删除当前激活模板
• 点击 OK 开始计算（每个选定算法将生成新列并写入计算结果）

2. Categories(该功能需单独购买)

使用内置分析功能，根据化合物成药性最相关的物理化学（PhysChem）、ADME和药物安全（Drug Safety）相关属性，将化合物区分为定性类别（Good、Average、Bad和Unknown）。

操作说明：

• 在文本框中输入内容可执行快速搜索。
• 显示可用的分析功能列表。
• 点击单个分析功能进行选择（按住Ctrl键可多选）。
• 使用箭头按钮在窗格间移动所选字段：
• 移动单个/多个选定字段
  
• 移动所有字段
• 显示已选择待计算的分析功能列表。
• 点击OK开始计算。每个定性化合物分类结果（Good/Average/Bad/Unknown）将写入电子表格的新建列中。

类别说明：

全文档使用通用类别名称："Good"（绿色）、"Average"（黄色）、"Bad"（红色）和"Undefined"（灰色）。但预定义分析功能采用反映底层属性分类的独特描述，例如：

• Ames测试："Mutagenic"="Bad"，"Non-mutagenic"="Good"
• HIA："Highly absorbed"="Good"，"Moderately absorbed"="Average"，"Poorly absorbed"="Bad"

3. Rank

执行化合物排序，即根据所选理化性质（PhysChem）、ADME或毒性（Tox）属性的有利/不利特征进行优先级排序。

操作说明：

• 在文本框中输入内容可执行快速搜索。
• 显示可用于化合物排序的所有列。仅包含定性类别数据（Good、Average、Bad、Undefined）的列可用于排序计算，因此列表中仅包含：注意：
  红色感叹号标记的列需预设置（通过Interval Manager窗口将连续数据划分为区间并分配类别）后才能用于计算排序。
• 使用内置分类算法计算的列
• 包含可由用户手动分类为上述类别的数值数据（ACD/Percepta计算或导入）的列
• 点击单个列进行选择（按住Ctrl键可多选）。
• 使用箭头按钮在窗格间移动所选字段：
• 移动单个/多个选定字段
• 移动所有字段
• 显示已选择用于化合物排序计算的列。
• 点击OK执行排序，结果将输出至新列（详见下文）。若选择了带红色感叹号的列，将弹出向导引导用户通过Interval Manager窗口分配必要类别。

新建Rank列说明

• 数值越小表示分子综合属性越优（升序排列后最优化合物显示在表格顶部）
• 相同数值表示化合物得分相同且共享排名位次（例如20个化合物均显示为"1"，则下一化合物从"21"开始）
• 排序组件（数据列）越多，得分变异性越大，化合物区分度越高
• 可为不同排序要素分配重要性权重

权重设置说明：

• 点击启用/禁用变量排名分数组件权重设置控件。
  这些控件会自动显示在对应排名计算使用的所有列上。若电子表格包含多个排名列，每次只能为其中一个激活权重设置控件——点击任一列的"启用"将自动禁用其他当前已激活排名列的控件。
  
  
• 激活状态下可通过列星级评分区分各分数组件的重要性。
  即属性处于有利/不利范围对最终排名分数的影响程度，取决于该属性分类数据列被赋予的星级。初始状态下所有组件自动分配相同权重。

类别说明：

全文档使用通用类别名称："Good"（绿色）、"Average"（黄色）、"Bad"（红色）和"Undefined"（灰色）。但预定义分析功能采用反映底层属性分类的独特描述，例如：

• Ames测试："Mutagenic"="Bad"，"Non-mutagenic"="Good"
• HIA："Highly absorbed"="Good"，"Moderately absorbed"="Average"，"Poorly absorbed"="Bad"

关于"Undefined"类别的说明：

在排名分数计算中，"Undefined"被视为仅次于"Good"的有利类别。这是因为"Average"和"Bad"明显不属于"Good"，而"Undefined"仍保留积极潜力（可能后续验证为"Good"）。这意味着相同属性下，"Undefined"化合物比"Average"更具研究价值（尽管需要进一步验证）。

4. Expression

表达式编辑器用作解析器，允许用户使用一套易于学习的语法规则创建复杂表达式。可利用数学和字符串函数，以及逻辑和算术运算符构建表达式。

界面操作说明：

• 编辑窗口：
• 支持直接输入表达式
• 通过双击下拉菜单中的函数/运算符实现快速插入
• 下拉菜单：
• 函数/运算符与字段分列显示
• 点击函数子菜单可展开/折叠选项列表
• 多菜单协同：
• 拖动菜单面板可同时查看多个下拉菜单（支持上下分屏显示）

语法限制

• 仅接受预定义函数列表内的合法表达式
• 变量用于标识数据库电子表格中的列。
• 变量按以下方式用方括号标识 -[变量]- ，显示为蓝绿色（绿蓝色）。示例：[ID]。
• 方括号不允许作为变量名称的一部分，而是用于将变量与筛选表达式的其他部分区分开。
• 左括号 "[" 后和右括号 "]" 前允许有空格。示例：[ ID ]
• 变量名称内不允许有空格；表达式编辑器会自动将其显示为酒红色（紫红色）的语法错误。示例：[I D]
• 变量内的文本不区分大小写。以下变量名称均相同：[ID] [Id] [iD] [id]
• 常规运算符显示为藏青色：+、-、/、*、<、>、<=、>=、<>、=。
• 函数始终显示为黑色。
• 逻辑运算符显示为黑色：And（与）、Or（或）、Not（非）。
• 函数后的参数必须始终用藏青色的括号括起。示例：Function (Argument)（函数（参数））
• 可使用静态常量。
• 实数常量显示为绿色。小数点表示小数，减号表示负数。示例：6、-7.45767。
• 也可识别科学计数法数字。指数可用大写或小写 "e" 表示。示例：-1.658476e - 5、-1.62E2 = -162。
• 字符串静态常量按以下方式用单引号标识 -'分子（molecule）'- ，显示为紫色。

待续！

相关链接

• 分子结构表单管理产品页（九大功能菜单总览）
• 原文：微信公众号「凯美科」