六、Fragmentate 菜单功能说明
导读:逆合成断键获取碎片、查找并用 R- 替换特定官能团,以及反应数据库(*.RDB)的创建与维护。本文为「分子结构表单管理」九大菜单系列详解之一,返回产品总览可查看九大菜单全景。
导读:逆合成断键获取碎片、查找并用 R- 替换特定官能团,以及反应数据库(*.RDB)的创建与维护。本文为「分子结构表单管理」九大菜单系列详解之一,返回产品总览可查看九大菜单全景。

运行逆合成碎片化。通过断裂一些有机合成常用反应(如酯化反应)可断裂的化学键来获得碎片。在首次弹出的对话框中,你可选择将活动电子表格的哪些字段转移到碎片电子表格(这有助于关联碎片和初始分子)。新创建的数据集会出现在"数据源(Data Source)"面板的"取代基(Substituents)"组中,自动命名为"Retrosynth"。
运行"查找并替换"碎片化。它用 R - 符号替换特定官能团。你需要一个包含碎片化规则的反应数据库文件(*.RDB)。在弹出的对话框中,你可选择反应数据库以及要转移到碎片电子表格的字段。

a.从下拉列表中选择反应数据库,或仅在数据库已创建时浏览本地电脑驱动器查找。要创建数据库,点击"反应编辑器(Reaction Editor)"按钮(见下文)。
b.选择活动电子表格中要转移到碎片电子表格的字段。
c.在窗格间逐个或一次性移动所有字段。
d.已选字段。
新创建的含反应的数据集会出现在"数据源(Data Source)"面板的"取代基(Substituents)"组中,自动命名为"ReplacedFragments(已替换碎片)"。
打开反应编辑器窗口以创建或修改反应集(*.RDB 文件)。

a.标准文件菜单命令用于新建、打开现有或保存当前反应数据库。
b.如需使用先前创建的反应数据库,可从下拉列表中选择。
c.Structure pane(结构面板)
d.获取二维输入结构的标准命令。
e.状态行显示当前可见反应数量及数据库中记录总数。
f.使用 + 或 - 添加/移除反应。

g.输入结构加载后,点击并套索选择需要替换为"R"(取代基)的原子
h.选中原子显示橙色高亮。如需修改选择,可重新套索原子
i.点击Accept确认选择
j.标记的结构片段将被替换为R1
k.点击取消已创建的反应
待续!