4.16 Eryngiolide A
Wang 等[18]成功分离并鉴定出一种新型大环二萜类化合物——Eryngiolide A(4.30),该化合物具有独特新颖的骨架结构,其母核由环十二烷与两个γ- 内酯单元稠合而成,此前未见文献报道。

α,β-不饱和内酯结构单元作为众多生物活性天然产物的关键药效基团,在Eryngiolide A的分子设计中同样具有重要地位。基于高分辨电喷雾质谱(HRESIMS)分析(检测值m/z =421.1834 [M+Na]⁺,计算值m/z = 421.1833),明确确定了Eryngiolide A 的分子式为C₂₀H₃₀O₈。文献[18]以表格形式提供了该化合物的13C 和1H NMR 谱数据,但仅以图形形式展示了部分关键的COSY 和HMBC 相关信号。
尽管可用的二维核磁数据有限,仍尝试基于这些信息进行计算机辅助结构解析。表4.16汇总了用于结构解析的光谱数据。
程序根据分子式及核磁共振初始数据自动构建了分子连接图(MCD),如图4.38 所示。

表4.16 Eryngiolide A: 核磁共振波谱数据

MCD 概述在分子连接图(MCD)中,绝大多数COSY 和HMBC 相关信号呈现出模糊性(以虚线标注)。这一现象主要源于¹³C NMR 谱中δC 20.3 处的四个重叠峰以及δC 26.8、33.5 和120.2处的三对重叠峰,同时¹H NMR 谱中δH 1.61 处也存在一对重叠峰。对于碳原子C(73.1)和C(73.5),其杂化状态被定义为sp²或sp³,其中C(73.1)未检测到任何相关信号。这意味着程序将尝试所有可能的拓扑连接方式,将C(73.1)嵌入分子结构中。文献[18]的作者指出:“结构中包含五个季碳,其中两个连有氧原子的碳(δC 73.1 和73.5)、一个烯碳(δC 139.5)以及两个酯羰基碳(δC 173.1 和182.0)。”虽然这些推测看似合理(反例见结构2.29),但在使用StrucEluc 软件进行结构解析时,我们通常可以避免引入非确证性假设,直接基于MCD启动结构生成。上述MCD 的特殊性显著增加了结构生成的复杂性,导致大分子结构的生成时间相对较长。
为优化解析效率,表4.16 中提供的四个¹H NMR 信号的多重性信息被用于约束相邻碳原子上氢原子的数量。例如,δH 3.04(双重峰,JHH = 8.2 Hz)表明其相邻碳原子上连接有一个氢原子。结构生成过程与¹³C 化学位移预测相结合(在生成过程中排除dI > 4 ppm 的结构),并通过结构和光谱过滤得到以下结果:k = 52 →26 →9,生成时间tg = 6 分钟。排名输出文件中的最优结构如图4.39 所示。

最终确定的最佳结构通过三种¹³C 化学位移预测方法均得到验证,并与结构4.30 完全一致(见结构4.31)。尽管存在大量模糊相关性,程序仍在合理时间内成功筛选出有效解决方案,充分展现了计算机辅助结构解析技术在复杂分子体系中的强大能力。

为探究文献[18]提出的化学环境假设对结构生成过程的影响,我们进行了以下尝试。将MCD 中"浅蓝色"标记的碳原子C(73.10)和C(73.5)重新定义为sp³杂化且与氧原子相邻(sp³/ob)时,结构生成时间从初始的6 分钟锐减至0.6 秒(k = 52 →26 →9),效率提升近600 倍。值得注意的是,优化后的生成结果与原始计算结果完全一致。
