Absolv 批量预测疏水性物质在有机溶剂里的溶解度
Absolv 是 Abraham 溶剂化参数的计算工具。其发明者 Abraham 教授基于溶剂化参数建立了很多有机溶剂与水的分配模型方程式,也能计算水中的溶解度。因此,基于该功能可以直接推算目标物质在有机溶剂中的溶解度。本文介绍使用 Absolv 模块批量预测化合物在不同有机溶剂中溶解度的完整操作步骤。
01 单结构预测:点亮溶剂方程
首先,打开 Percepta,找到 Equations。在 Water-solvent partition 下找到需要预测的有机溶剂并点亮,再在 Solubility 下把水溶解度功能点亮。
在结构窗口中输入结构后,软件就会给出该结构在水中的溶解度及不同有机相和水相的分配系数。下图所示为物质在甲醇、乙腈、DMSO 和正辛醇中的分配系数,根据 logSs = logSw + logP,可算出物质在不同有机相中的溶解度。
02 批量预测:导入结构库
在 Data Source 中点击 New project,软件会自动创建一个 My Project;点击 File > Import,上传存储的结构文件——可以是 SDfile 结构库文件或批量的 mol 结构文件。
点击 Calculate > Properties,在跳出的窗口中输入 Equation,软件会自动找到已点亮的分配系数计算公式和水溶解度计算公式,全部添加到右边窗口,点击 OK,软件开始批量计算。
03 自定义表达式:推算有机相溶解度
计算完成后,用户可自定义公式,让软件批量自动计算在不同有机相中的溶解度。点击 Expression,在跳出的窗口中点击 Fields/Columns——这里显示的内容与用户勾选的有机溶剂 Equation 保持一致。例如要让软件批量计算物质在甲醇中的溶解度,则双击 logP(Methanol, d) 添加到左边的窗口中;再点击 Functions > General Operators,双击 + 添加到左边窗口后,回到 Fields/Columns 双击 logSw(mol/L)。公式编辑完成后点 OK。
在预测结构显示界面会多出来一栏,该栏显示的数值即为物质在有机相中的溶解度;双击 Expression 可对该栏重命名。重命名后的结果如下——用户可以重复以上步骤,设定其它有机相的溶解度计算公式,让软件批量完成计算。
04 使用提示
以上功能可以基本满足分析部门对难溶于水的物质的溶剂计算化筛选,以及合成部门后处理溶剂的筛选。注意:使用 Absolv 模块计算疏水性的物质会较为准确;亲水性的物质(logD 或 logP 低于 0)请慎用此功能。
如需了解 Absolv 模块的更多信息,欢迎联系我们。
