Structure Elucidator Suite 专题介绍(二):核磁预测技术
上文介绍中,我们提到了ACD/Structure Elucidator Suite软件主要由四个功能模块组成,分别是:核磁谱图数据库、核磁谱图预测、智能解析以及数据库构建,通过不同功能的协作可帮我们提高结构解析工作的效率。

下面小编为大家接着介绍ACD/Labs的核磁预测功能,究竟它的预测准确性如何?该功能在结构解析工作如何发挥作用?
二、ACD/Labs基于化学结构的核磁谱图预测
功能及原理
ACD/Labs的核磁预测模块名为ACD/NMR Predictors,可基于化合物的二维结构式预测1H、13C、15N、19F、31P、2D NMR谱图((HSQC, HSQC-TOCSY, HMBC, COSY等)。用户可指定溶剂、频率等条件进行1H、13C NMR谱预测,并且支持混合物在不同比例下的谱图模拟。
ACD/NMR Predictors基于HOSE编码和神经网络算法实现核磁谱图计算,后台庞大的实验化学位移值进行模型训练优化,支撑数据量如下:

以下是某化合物其中一个碳原子的化学位移预测结果,比较了实验值、ACD/Labs软件以及ChemDraw软件三者的结果。从结果可知,ACD/Labs的预测结果很接近实验值,之所以能预测这么准确,得益于后台庞大的实验数据支撑。右图显示后台支撑的具有类似化学环境的实验数据集:

下面是软件的操作演示视频:
预测准确性评测
关于预测准确性的评测,我们先引用上文提到的化合物举例,列出该化合物所有的碳原子化学位移预测结果进行比较:


上图的结果表明,ACD/Labs的NMR预测结果比ChemDraw的更准确,RSD标准偏差为1.3758。
当然,这仅是一个化合物的数据比较,下面通过一篇第三方文献(https://doi.org/10.1016/j.fitote.2018.10.003)的评测数据,展示三款软件(ACD/Labs、Mnova、ChemDraw)批量预测天然产物13CNMR化学位移的结果比较,作者通过80个天然产物结构,根据不同的结构类型分别进行了比较:

ACD/Labs(蓝色)、Mnova(红色)、ChemDraw(绿色)三款软件对80个天然产物的碳谱化学位移预测结果比较
结果表明,ACD/Labs比其他两款软件的预测准确性要更高。基于ACD/Labs能提供73%误差在+-1.25ppm范围的结果,作者构建了专属的天然产物ACD预测谱图库成功用于结构排重。
基于核磁谱图预测技术的应用
那么,在实际的化合物结构鉴定工作中,基于化合物结构式预测核磁谱图的预测技术应该如何发挥作用呢?下面举几个例子:
结构自动归属验证
对于化学合成的研究者,可通过ACD的核磁预测技术进行快速的结构确认,比如把目标化合物结构的预测谱图与实验谱进行比对评分,在ACD/Spectrus processor基础模块中提供了一键归属验证的功能就是基于该技术开发而来,如下图所示:

同分异构体判别
在化合物的结构定性中,往往出现同分异构体的不同可能性,这时候可利用核磁预测谱与实验谱的比对,通过误差值比较来判别哪种结构更有可能,如下图所示,通过不同取代位置的预测谱图与实验谱比对,可快速确认可能的取代位置。

构建核磁预测谱库进行结构排重
得益于ACD/Labs的核磁预测准确性较高,我们可构建预测碳谱数据库,如上文提到的文献,作者正是通过构建专属的天然产物预测碳谱数据库进行结构排重(https://doi.org/10.1016/j.fitote.2018.10.003)。文章思路如下图:


