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基于性质的结构优化:操作演示

在先导化合物结构优化阶段,药物化学家往往会基于先导物的骨架结构进行衍生化,以期获得活性更高、药代性质更理想或者毒性更低的化合物。相对于人为经验设计衍生物的方法,计算机辅助药物设计也许提供更快速的药物发现途径。

内建在成药性预测软件Percepta中的一个小工具——Structure Designer,可基于片段库对先导物结构进行衍生物的设计。

Structure Designer 应用流程
Structure Designer 应用流程

01 基本操作流程

  • Structure Designer的基本操作流程如下:
  • 1、先导化合物的结构导入
  • 2、片段取代位点的选取
  • 3、片段库的性质范围选择
  • 4、衍生物库的生成
  • 5、衍生物库的性质预测、筛选
  • 以下是该软件的操作演示:

02 结语

从先导化合物结构出发,基于片段库进行衍生物设计,从而再进行虚拟筛选,这是药物设计中常用的策略。而Structure Designer软件为从事药物化学、药物设计领域的研究者提供了一个简单易用的平台,并且结合Percepta的理化性质、ADME/Tox性质预测模块,可快速地进行成药性评价、筛选。在实际应用中,用户还需结合其他的手段,对活性、成药性、合成可行性等方面进行综合筛选。

本文内容整理自凯美科公众号文章,原文中的推广信息与联系方式已去除。如需了解相关模块与 Structure Designer 的更多信息,欢迎联系我们。