4.32 Schizocommunin
Schizocommunin 于1999 年首次从单核菌株Schizophyllum commune IFM 46788 的液体培养基中分离并报道。基于初步研究,研究人员提出了Schizocommunin 的可能结构如下所示:

由于天然来源的Schizocommunin 供应量极其有限,其生物学研究受到严重制约,且迄今为止未见其全合成的报道。尽管光谱分析表明,Schizocommunin 的结构包含4-羟基喹啉和羟吲哚骨架,并通过亚甲基连接(如图Z (hydroxy) 所示,见图4.83),但其烯烃双键的构型未得到详细讨论。因此,4.65 可能具有几何异构体Z (hydroxy) 和E (hydroxy),或互变异构体Z (keto) 和E (keto)。

最近,Uehata 等[36]通过全合成方法制备了Schizocommunin 的推测结构Z (hydroxy) 及其几何异构体E (hydroxy),并发现两者均以酮形式存在。然而,合成的Z (keto) 和E (keto)的¹H NMR 谱图与天然Schizocommunin 的报道数据并不一致。基于此,研究人员对天然Schizocommunin 的NMR 和IR 数据进行了重新分析,提出了修订结构——喹唑啉酮4.66。通过一步合成成功制备的Z-4.66,其所有光谱数据均与天然Schizocommunin 的报道数据完全一致。

作者对该问题进行了系统研究,开发了相关化合物的合成方法,并最终对Schizocommunin 的原始结构进行了修订[36]。
我们推测,若在该化合物首次分离时采用计算机辅助结构解析(CASE)方法,可能无需进行结构修订,仅通过X 射线晶体学分析即可完成最终结构确证。基于这一假设,我们将从支持信息[36]中提取的Schizocommunin 分子式(C₁₇H₁₁N₃O₂)以及一维和二维核磁共振(NMR)数据输入Structure Elucidator 软件中。值得注意的是,n(骨架原子数)/n(氢原子数)= 2,表明该分子极度缺氢,因此问题极具挑战性(参见第1.2.2 节)。相关数据列于表4.32 中,其中原子编号与结构4.66 中的编号一致。

通过创建分子连接图(MCD,图4.84),我们识别出两个孤立的碳原子组,并确认其为两个苯环。苯环中的碳原子通过类COSY 相关信号连接。红外光谱(IR)显示,在1,675和1,685 cm⁻¹ 处存在两个明显的羰基吸收带,因此将碳原子C 160.8 和168.8 与氧原子通过双键连接。

在结构生成过程中,我们选择了“Allow Bonds between Heteroatoms of the Same Atom Type(允许同类型杂原子之间成键)”的选项,并在生成过程中计算了¹³C NMR 化学位移,同时采用过滤程序(剔除偏差值d > 5 ppm 的结构)。结果为:k = 3,614 →44 →22,总耗时为2 秒。输出文件中按dA 偏差(基于HOSE 算法的谱图预测)排序的前八种结构如图4.85所示。

从图中可以看出,Schizocommunin 的真实结构在三种化学位移预测方法中均被选为最可能的结构。图4.86 展示了Z-和E-构型的分子及其¹³C 化学位移归属。

此外,我们还探究了若在MCD 中允许N=N 键生成,原始结构和修订结构在排名中的表现。图4.87 展示了包含游离氮原子的相应MCD。

在与首次运行相似的条件下,基于该MCD (图4.87)进行了结构生成,得到以下结果:k= 176,535 →344 →297,总耗时为2 分10 秒。输出文件中按dA 偏差排序的前八种结构如图4.88 所示。

图4.88 显示,原始结构在排名中位列第八,进一步证实了修订结构的优先性。考虑到所有结构非常相似,且dA(2) 和dA(1) 之间的偏差差异小于1 ppm,通过X 射线晶体学分析对修订结构进行确证是必要的。文章[36]的作者已完成了这一分析,为修订结构的准确性提供了最终验证。
这一案例充分展示了StrucEluc 系统在天然产物结构修订中的重要作用,它能够显著优化基于化学合成的结构确证策略。通过高效的结构生成与筛选,该系统能够在几分钟内明确最可能的结构,从而避免不必要的全合成实验,极大地节省了时间和资源。此外,结合经验性化学位移预测,StrucEluc 系统能够快速排除错误的结构假设,进一步提升研究的效率和准确性。这不仅为天然产物的结构解析提供了更加精准和可靠的方法,也为未来类似研究提供了重要的方法论参考。
