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杜邦:用 NMR 预测解析聚合物与复杂混合物

NMR谱图预测聚合物复杂混合物NMR Predictors

案例摘要:在 ACD/Labs 制药研发数字化研讨会上,DuPont(杜邦)核心分析科学部首席研究员 Ⅱ Yiyong He 分享了其团队 18 年使用 NMR Predictors 的经验。面对聚合物与十组分以上的复杂混合物(含微量组分浓度可低至 1% 以下),团队以局部结构预测替代繁琐的 2D NMR,将 2D NMR 实验需求降低 95% 以上,并凭预测完成端基指认与混合物逆向解析,实现了从「实验分析人员」到「创新研究者」的跨越。

01 背景与挑战

Yiyong He 所在的 DuPont 核心分析科学部独立于各业务线,为全公司提供基于分析科学的支持,工作涵盖研发支持、应用开发、生产制造及客户技术支持。他职业生涯中的主要挑战,是复杂样品的 NMR 分析——这类样品通常是聚合物与小分子的混合物,常含十种以上组分,且关键信息往往来自含量极低的微量组分(浓度可能仅为百分之一甚至更低)。作为该软件 18 年的忠实用户,他推荐身边同事也加以运用。

DuPont 复杂样品NMR分析挑战
图1. 复杂样品 NMR 分析:聚合物 + 小分子混合物,常含十种以上组分,微量组分浓度可低至 1% 以下

02 三种 NMR 数据解析路径

从谱图到结构,通常有三种方法:

  • 传统解析方法:运行一系列 2D NMR 实验,建立碳碳、碳氢等相关信号连接,逐步推导可能结构;
  • 数字化与先进计算:将已有谱图数据存入数据库,通过未知谱图与数据库匹配寻找参考结果;
  • 预测方法:依托算法或理论预测谱图,再用实验数据验证或修正。

三种方法 He 都用过,但目前以预测方法为主——这与其所从事工作的具体性质相关。

03 三类典型工作

  • 聚合物研究:聚合物结构变化近乎无限(如简单嵌段共聚物即可形成嵌段、无规、交替等多种形态),通过谱图完全解析整体结构极为困难,通常只关注局部结构——这正是 NMR Predictors 的绝佳应用场景;
  • 复杂混合物的逆向解析:十组分以上、谱峰严重重叠,2D NMR 与数据库检索均难以直接适用;
  • 发现性分子的合成与表征:目标分子首次合成,数据库中无现成谱图可参照,基于数据库的匹配方法难以生效。

04 工具选型:为什么是 ACD?

过去数十年,He 与同事多次对比评估商业预测软件与学术界免费工具,结论始终一致:ACD/Labs 的 NMR Predictors 在预测准确性上优于测试过的所有其他工具。例如一个非特意挑选的分子,同时运行 NMR Predictors 与 Mnova 预测对比——表格中一半碳原子(黑色字体)两者都相当准确,而另一半红色高亮的值,ACD 给出更准确的预测结果。

ACD与Mnova预测对比,红色高亮ACD更准
图2. NMR Predictors 与 Mnova 预测对比:红色高亮碳原子处 ACD 给出更准确的预测

He 还特别看重几个特性:

  • 置信水平指示:每个预测信号提供置信度。经验法则——实测与预测偏差 <2 ppm 通常结构归属正确;2–5 ppm 需其他技术复核或考虑替代结构/溶剂效应;>5 ppm 通常意味着推测结构可能有误;
  • 灵活选择算法与数据库:对与溶剂有较强相互作用的分子,可限定仅采用与实测溶剂完全一致的子数据集,显著提升准确性;
  • 来源结构信息显示:点击谱图中特定碳原子信号,系统标示该原子所属结构片段及预测所用溶剂,具有参考价值。
预测结果界面:置信度指示与来源结构信息
图3. 预测结果界面:每个信号均提供置信度指示条;点击碳原子可查看预测所参考的来源结构与溶剂

05 三个快速示例

示例一 聚合物研究(聚环氧丙烷端基指认)

聚合物 T₂ 弛豫时间短,部分交叉峰可能在 2D NMR 中缺失,He 无法完全依赖 2D NMR 解析聚合物。绘制完整长链通常不可行,多数情况只需获取局部结构信息(官能团、端基、支化序列)。以聚环氧丙烷的 13C NMR 为例:谱图主要显示五个主链碳信号及三个次要信号,其中第二、三个次要峰很可能对应聚合物端基。由于环氧丙烷为不对称单体,两个单体连接可形成头-头或头-尾两种方式。针对两种连接分别建模预测,重点关注端基区域——预测化学位移与实测次要峰高度吻合,结合其他信息可靠地将其归属为端基各碳原子。

聚环氧丙烷端基两种连接模型
图4. 头-头 / 头-尾两种连接方式的端基模型
端基预测与实测吻合
图5. 端基区域预测值与实测次要峰高度吻合

示例二 复杂混合物逆向解析(商业固化剂)

一张商业固化剂的 13C NMR 谱图含六个主要组分及数个微量组分,已对所有主要信号数字标记并划分为九组(组分六、信号组九,是因为部分组分信号严重重叠、仅能识别部分结构片段)。以第 5 组为例:其强度居第二高,初步判断属同一分子,具有芳香结构、两个取代基(可能为羧基、呈苯酚特征),取代基可能存在间位或对位等位置异构。快速尝试不同取代模式并将预测与实测比对,发现对位取代模型匹配最佳(少数峰位仍有约 3–4 ppm 偏差)。为谨慎起见,邀请同事以质谱确认该组分存在,结果一致。

固化剂第5组对位取代模型匹配最佳
图6. 固化剂第 5 组信号:对位取代模型的预测谱与实测信号匹配最佳,并经质谱确认

示例三 发现性分子合成(脲与醛反应的二聚体)

脲与醛反应的最终产物 13C NMR 谱中,可归属碳信号约 20 个(接近结构 B 碳数的两倍)。进一步观察发现部分信号成对出现(两个羰基峰、两个 60 ppm 附近的含氧碳、丁基末端甲基峰 9 与峰 10),提示产物可能为结构 B 的二聚体。尝试每个分子中三个高反应活性碳原子的多种连接方式并预测,与实验谱比较,发现形成另一个六元环的结构匹配最佳(预测与实验多数偏差 <2 ppm,仅两个信号偏差约 4 ppm)。为谨慎验证,进一步以 2D NMR(HSQC、HMBC)确认关键连接,并请同事运行 LCMS 独立验证,结果均证实该结构存在。

二聚体E结构预测与实验比较
图7. 二聚体 E 的预测谱与实验谱比较(多数偏差 <2 ppm)
最终反应路线
图8. 最终反应路线:推测产物为结构 B,实际鉴定为二聚体 E

06 总结

He 认为,任何单一工具都不是万能的,实际应用中往往需要结合其他分析技术提供互补信息或验证,一定的有机化学背景也是加分项——使用预测工具时仍需使用者提出合理的候选结构假设。对他而言,ACD/Labs 的 NMR Predictors 显著降低了对 2D NMR 的依赖,相关实验需求减少 95% 以上,每年只需运行少数几次;多数情况下,一张定量的 DEPT 135 谱已足够支持初步结构推断。该工具尤其适用于局部结构分析——无需完整谱图数据,只要能基于若干信号提出可能的结构片段即可预测验证;还能用于快速筛选想法,在小组讨论中即时提出新假设并迅速缩小合理候选范围。

凯美科提示:聚合物、复杂混合物与发现性分子,是核磁解析中 2D NMR 难以直接胜任的典型场景。NMR Predictors 以局部结构预测替代繁琐的二维实验,在 DuPont 等企业的日常研究中已大规模落地。如您所在实验室也面临类似挑战,欢迎联系我们了解预测工作流与本地化部署建议。

参考资料

  • Yiyong He(DuPont). NMR Predictors 在聚合物研究与复杂混合物分析中的应用. ACD/Labs 制药研发数字化研讨会报告(完整视频 24:40)。
  • 本文整理自微信公众号「凯美科」发布的客户案例文章。
  • 关键技术:NMR Predictors(13C NMR Predictor、置信水平指示、算法/数据库子数据集选择、局部结构预测)。

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