Percepta 平台:加速药物发现的成药性预测及结构优化工具
作为药物化学家,您需要快速获取关键化合物数据来指导分子优化决策。Percepta 平台提供了一套专为药物研发设计的计算工具,帮助您预测和管理核心分子特性数据。本文介绍 Percepta 平台的预测模块构成、模型定制化能力与核心应用场景。
01 预测模块总览
Percepta 平台的预测能力覆盖理化性质、ADME、毒性三大板块,并提供先导化合物结构优化工具:
| 理化性质预测 | 水溶性、沸点/蒸气压、LogD、LogP、pKa、Absolv(Abraham 溶剂化参数)、极性表面积、类药 5 规则、密度、摩尔折射、Sigma 参数 |
|---|---|
| ADME 预测 | 血脑屏障渗透性、CYP 抑制剂、CYP 底物、表观分布体积 Vd、血浆蛋白结合率、口服生物利用度、透膜性(HIA、Caco-2)、P-gp 特异性、PK 参数、代谢位点、最大推荐日剂量 |
| 毒性预测 | 急性毒性 LD50、水生毒性、内分泌系统干扰、致突变性、健康影响作用、hERG 抑制、刺激性、药物杂质毒性评价 |
| 先导化合物结构优化 | 衍生物库设计、片段库设计、批量筛选可视化工具、自定义筛选参数 |
从模块构成看:PhysChem Suite 对应理化性质预测板块,ADME Suite 对应 ADME 预测板块,Tox Suite 对应毒性预测板块,Structure Designer 对应先导结构优化工具——Percepta 平台即上述模块的完整组合。
02 核心功能与工作流整合
关键性质预测。输入结构后,平台可批量给出理化性质、ADME/Tox 特性(吸收、代谢稳定性、hERG 抑制等)以及药物相似性评估结果:
模型定制化。使用您团队的实验数据训练专属预测模型,优化针对特定靶点或化学系列的预测准确性,并可整合内部已验证的计算方法。Ames、CYP 各亚型等预测器均支持以可训练库的形式管理:
数据管理。集中管理预测算法和训练数据集,确保团队使用统一、更新的计算模型;自动化性质计算流程,减少人工误差。
03 提升研发效率
通过 Percepta 平台,您可以在以下关键研发节点获得数据支持:
- 先导化合物优化:预测结构修饰对成药性质的影响,减少"设计—合成—测试"循环;
- 化合物库设计:虚拟筛选具有理想 ADMET 特性的候选分子;
- 风险评估:早期识别潜在毒性或代谢问题;
- 项目决策:基于统一数据集评估化合物开发潜力。
04 技术优势
平台整合了经过 25 年使用验证的计算模型,同时支持根据特定项目需求建立定制模型。通过将经验证的计算方法与团队专属数据相结合,Percepta 帮助缩短"设计—合成—测试"周期,加速高质量候选化合物的发现:
- 经过长期验证的模型:模型和算法作为计算机模拟计算工具的核心组件,已被各大制药和环境研究机构使用超过 25 年,并长期与权威数据库 SciFinder 合作提供可靠的预测数据;训练数据库基于精心筛选的实验数据,可提供快速且可靠的结果。
- 结果可靠性可自行评估:通过计算方案、可靠性指数、数据库中相似结构的展示以及实验数据的文献参考,用户可自行判断每个预测值的可信程度。
- 易于使用:绘制或导入结构即可计算性质,任何人都可以进行模型训练,不需要计算化学或编程经验。
- 数据洞察:通过结构上的颜色映射可视化亚结构/原子对特性值的贡献(部分预测模块提供);使用绘图、筛选、排序和排名工具识别趋势并确定化合物优先级。
- 可扩展至第三方模型:将现有的特性计算工具整合在一个平台,包括团队自建的模型和第三方算法。
基于性质的结构优化界面支持对取代基进行逐位调节,并同步显示溶解度、logD、logP、pKa 等性质的预测变化,辅助结构修饰决策:
05 客户评价
"这是我使用过的最好的计算机模拟毒性软件。它非常易于使用,可以获得大量信息。"
—— Tim Tam,Apotex Pharma
"ACD/Labs 的理化性质和 ADMET 预测软件以简单直观的操作界面和出色的图形输出,提供了关于化合物类药性的丰富信息。"
—— Bill Simmons,Loyola University
"对 CYP 抑制的预测准确性令人印象深刻。它已成为我们早期药物发现工作流程中不可或缺的工具。"
—— Sarah Chen,Novo Pharmaceuticals
"我们选择 Percepta 的主要原因在于其易用性、可配置性以及使用现有内部算法的能力。"
—— 默克公司(Merck KGaA)
Percepta 平台整合理化性质预测(pKa、logP 等)、ADME/Tox 性质评估以及先导化合物结构优化等功能模块,为药物研发人员提供分子性质预测解决方案。如需了解 ADME Suite、Tox Suite 或平台的更多信息,欢迎联系我们。
本文整理自凯美科公众号文章《Percepta 平台:加速药物发现的成药性预测及结构优化工具》。
